V molekularni biologiji je STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) biološka baza podatkov in spletni vir znanih in predvidenih interakcij beljakovin in beljakovin. … Najnovejša različica 11b vsebuje informacije o približno 24,5 milijona beljakovin iz več kot 5000 organizmov.
Kaj je namen baze podatkov STRING?
Namen baze podatkov STRING zbira in integrira te informacije z združevanjem znanih in predvidenih beljakovin–podatkov o povezovanju beljakovin za veliko število organizmov.
Kaj je rezultat STRING?
V STRING je vsaka interakcija med beljakovinami in beljakovinami označena z enim ali več »rezultati«. Pomembno je, da ti rezultati ne kažejo moči ali specifičnosti interakcije. Namesto tega so kazalniki zaupanja, to je, kako verjetno STRING oceni, da je interakcija resnična, glede na razpoložljive dokaze.
Zakaj beljakovine medsebojno delujejo?
interakcije med beljakovinami in beljakovinami (PPI) so fizični stiki visoke specifičnosti, vzpostavljeni med dvema ali več beljakovinskimi molekulami kot posledica biokemičnih dogodkov, ki jih vodijo interakcije, ki vključujejo elektrostatične sile, vodik povezovanje in hidrofobni učinek.
Kaj je funkcionalna povezava?
definicija. Binarno razmerje med biološkimi entitetami, ko eden od njih modulira drugega v smislu funkcije, izražanja, degradacije ali stabilnosti drugega in razmerjamed partnerjema ni mogoče ugotoviti kot neposredne, zato so vmesni koraki implicitno prisotni.
