Peptidne vezi imajo planarno, trans, konfiguracijo in so podvržene zelo malo rotacije ali zvijanju okoli amidne vezi, ki povezuje α-amino dušik ene aminokisline s karbonilnim ogljikom naslednjega (slika 4-1).
Zakaj je rotacija peptidne vezi prepovedana?
Zakaj je rotacija okoli peptidne vezi prepovedana in kakšne so posledice pomanjkanja rotacije? Peptidna vez ima delni znak dvojne vezi, ki preprečuje rotacijo. To pomanjkanje rotacije omejuje konformacije peptidne hrbtenice in omejuje možne strukture.
Ali se peptidne vezi lahko upognejo?
Ker je hrbtenica polipeptida, ki se drži skupaj s peptidnimi vezmi, fleksibilna (zaradi "rotacije okoli vseh teh vezi"), se lahko veriga upogne, zvije, in se upogne v zelo veliko različnih tridimenzionalnih oblik.
Ali so peptidne vezi reverzibilne?
Čeprav je mogoče tvorbo peptidne vezi obrniti z dodatkom vode (hidroliza), so amidne vezi zelo stabilne v vodi pri nevtralnem pH in hidroliza peptidnih vezi v celicah je tudi encimsko nadzorovan.
Ali imajo peptidne vezi usmerjenost?
Čeprav je geometrija peptidne skupine fiksna, se lahko vezi na obeh straneh alfa-ogljika vrtijo. To omogoča fleksibilnost v peptidni hrbtenici. … Zaporedje aminokislin v beljakovinah ima usmerjenost aliusmerjenost, ki jo definirajo funkcionalne skupine na koncih verige.
