Večina restrikcijskih encimov prepozna palindromska zaporedja, kar pomeni, da imata obe verigi DNK enako zaporedje, ko se bere od 5′ do 3′.
Ali vsi restrikcijski encimi prepoznajo palindromska zaporedja?
Restrikcioni encimi tipa IIQ cepijo DNK simetrično znotraj njihovega prepoznavnega zaporedja, ki se od palindroma razlikuje za en bazni par. Izvor encimov tipa IIQ je lahko posledica podvajanja in evolucijskih sprememb v genih omejevalnih encimov prednikov, ki prepoznajo palindromsko zaporedje DNK.
Ali restrikcijski encimi režejo DNK na palindromnih mestih?
Restrikcione endonukleaze so razred encimov, ki prepoznajo specifična zaporedja DNK, običajno palindrome s 6 do 8 baznimi pari, in običajno režejo hrbtenico DNK na simetrični točki znotraj zaporedja prepoznavanjana obeh pramenih.
Ali so mesta z omejitvami vedno palindromska?
To so na splošno palindromska zaporedja (ker se restrikcijski encimi običajno vežejo kot homodimeri), določen restrikcijski encim pa lahko prereže zaporedje med dvema nukleotidoma znotraj svojega mesta prepoznavanja ali nekje v bližini.
Zakaj ima restrikcijski encim palindromsko zaporedje?
Pojasnilo: Encimi, kot so restrikcijski encimi, morajo prepoznati zelo specifično zaporedje, da lahko izpolnijo svojo nalogo. Na DNK se veže samo v eni specifični konfiguraciji. … Tudi palindromsko zaporedjepoveča možnost, da sta obe verigi DNK prerezana.
