BLAST se lahko uporablja za več namenov. Ti vključujejo prepoznavanje vrst, lociranje domen, vzpostavitev filogenije, preslikavo DNK in primerjavo. Z uporabo BLAST-a lahko morda pravilno identificirate vrsto ali poiščete homologne vrste.
Za kaj se uporablja BLAST?
BLAST je računalniški algoritem, ki je na voljo za uporabo na spletu na spletnem mestu Nacionalnega centra za biotehnološke informacije (NCBI) in na mnogih drugih mestih. BLAST lahko hitro uskladi in primerja zaporedje DNK poizvedbe z bazo zaporedij, zaradi česar je kritično orodje v tekočih genomskih raziskavah.
Kaj je tehnika BLAST?
Tehnika BLAST je metoda za reševanje pritožb, ki jo je razvil Albert Barneto . Mnemonika pomeni Verjemi, Poslušaj, Opraviči se, Zadovolji in Hvala (tabela 1). 6. Ta članek opisuje njegovo uporabnost pri oskrbi bolnikov in kot klinično učno orodje.
Kako BLAST deluje na DNK?
Kako deluje BLAST? BLAST identificira homologna zaporedja z uporabo hevristične metode, ki na začetku najde kratka ujemanja med dvema zaporedjema; tako metoda ne upošteva celotnega zaporednega prostora. Po začetnem ujemanju poskuša BLAST začeti lokalne poravnave iz teh začetnih tekem.
Zakaj je BLAST hitrejši od Faste?
V smislu kompleksnosti algoritma je BLAST hitrejši od FASTA z iskanjem samo pomembnejših vzorcev vzaporedja. Občutljivost (ali natančnost) BLAST in FASTA se običajno razlikuje za zaporedja nukleinskih kislin in beljakovin (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
