Arabinoza je sladkor s petimi ogljiki, ki ga pogosto najdemo v naravi in lahko služi kot edini vir ogljika v številnih bakterijah. Beljakovinski produkti treh genov (araB, araA in araD) so potrebni za razgradnjo arabinoze pri članih družine Enterobacteriaceae, kot sta E. coli in S.
Kaj arabinoza naredi bakterijam?
Tako, ko je prisotna arabinoza za vklop arabinoznega operona, se proizvede GFP in bakterije lahko fluorescirajo. Brez arabinoze gen GFP ni izražen in ni fluorescence. Tako lahko raziskovalec s spreminjanjem sestave hranil nadzoruje, kdaj (in če) pride do florescence v transformiranih bakterijah.
Kakšna je vloga arabinoze pri bakterijski transformaciji?
Arabinoza deluje kot alosterični regulator AraC, spreminja, na katera mesta DNK se veže in kako tvori dimer. Ne pozabite, da je arabinoza sladkor, ki ga katabolizirajo beljakovine operona AraBAD. Ko se arabinoza doda v okolje, v katerem živi E. coli, se tesno veže na AraC.
Zakaj se uporablja arabinoza?
Uporaba v biologiji
V sintetični biologiji se arabinoza pogosto uporablja kot enosmerno ali reverzibilno stikalo za izražanje beljakovin pod Pslabopromotor v E. coli. To vklopno stikalo je mogoče izničiti s prisotnostjo glukoze ali pa ga obrniti z dodajanjem glukoze v gojišče, kar je oblika zatiranja katabolita.
Kakoali arabinoza vpliva na regulacijo genov in izražanje v bakterijah?
Ko je prisotna arabinoza, araC sprosti konfiguracijo DNK, tako da lahko pride do transkripcije, ko pa tega ogljikovega hidrata ni, isti protein omejuje DNK, da zmanjša njeno sposobnost vezave z RNA polimerazo.
