Prolin se pogosto nahaja na koncu α vijačnice ali v zavojih ali zankah. Za razliko od drugih aminokislin, ki obstajajo skoraj izključno v preoblikovanju v polipeptidih, lahko prolin obstaja v cis-konfiguraciji v peptidih.
Ali alfa vijačnice vsebujejo ostanke prolina?
Zdaj, ko je v banki podatkov o beljakovinah več kot 30.000 beljakovinskih struktur, je jasno, da so ostanki prolina prisotni v α-vijačah, kjer pogosto igrajo pomembno vlogo v strukturi in funkciji beljakovin.
Katere aminokisline so v alfa spiralah?
V α-vijačnici lahko sodeluje katera koli od 20 aminokislin, vendar so nekatere bolj priljubljene kot druge. Ala, Glu, Leu in Met se najpogosteje nahajajo v vijačnicah, medtem ko je manj verjetno, da bi jih opazili Gly, Tyr, Ser in Pro.
Ali beta listi vsebujejo prolin?
Proline ni priljubljen v strukturah beta listov, ker ne more dokončati H-vezovalnega omrežja. Kadar se prolin pojavlja v listih, je lahko v izboklini ali robu lista, kjer pomanjkanje donerja amino vodikove vezi ni kritično.
Kaj vsebuje alfa vijačnice?
Alfa vijačnica (α-helix) je pogost motiv v sekundarni strukturi beljakovin in je konformacija desne vijačnice, v kateri vsaka hrbtenica N-H skupina vodik veže na hrbtenico C=O. skupina aminokislin, ki se nahaja štiri ostanke prej vzdolž zaporedja beljakovin.
