Nasprotno pa večina evkariontskih DNK ligaz, skupaj z arhealnimi in bakteriofagnimi encimi, spada v drugo poddružino; ti encimi uporabljajo ATP kot kofaktor.
Ali ligaze zahtevajo ATP?
Običajno se uporabljata dve DNK ligazi. … T4 ligaza zahteva ATP , medtem ko ligaza E. coli zahteva NAD+ (nikotinamid adenin dinukleotid je koencim, ki je sestavljen iz 2 nt, povezanih preko svojih fosfatnih skupin). Oba katalizirata spajanje 5′-fosfatne in 3′-OH skupine, da tvorita fosfodiestrovsko vez.
Zakaj ligaze potrebujejo ATP?
Dva koraka reakcije ligacije DNK
Sama reakcija ligacije DNK ima dva osnovna koraka. Prvič konci DNK morajo po naključju trčiti in ostati skupaj dovolj dolgo, da se jim ligaza pridruži. … Da bi encim lahko izvedel nadaljnje reakcije, je treba AMP na aktivnem mestu encima napolniti z ATP.
Kakšna je funkcija ligaz?
DNA ligaze igrajo bistveno vlogo pri ohranjanju genomske celovitosti tako, da združujejo prelome v fosfodiesterski hrbtenici DNK, ki nastanejo med replikacijo in rekombinacijo, ter kot posledica poškodbe DNK in njene popravilo. Trije človeški geni, LIG1, LIG3 in LIG4 kodirajo od ATP odvisne DNK ligaze.
Kaj so ligaze, delujejo aktivno ali pasivno?
DNA ligaza je aktivna med replikacijo, postopkom popravljanja in rekombinacije DNK. Široko se uporablja pri popravilu enojnih pramenovzlomi dupleksne DNK živih organizmov z uporabo komplementarne verige dvojne vijačnice kot predloge, medtem ko nekatere oblike lahko posebej popravijo dvoverižne poškodbe.
