Ker lahko zvočna obdelava potencialno razgradi beljakovine in denaturira proteinski epitopi, smo nato ocenili vpliv ultrazvočne obdelave na celovitost beljakovin.
Ali lahko ultrazvok poškoduje beljakovine?
Priljubljeni odgovori (1)
Standardni protokol ultrazvočne obdelave namesto ne more povzročiti fragmentacije beljakovin- energija je prenizka. Sploh ne bi smel povzročiti njegove denaturacije. Lahko se denaturira, če ga predolgo obdelujete in pregrejete vzorec. Če uporabljate nikljevo kromatografijo, so lahko drugi pasovi preprosto nečistoče.
Ali lahko ultrazvočna obdelava razbije peptidne vezi?
Soniranje običajno ne more razbiti primarne struktureproteina, ker je ta struktura (zaporedje aminokislin) zgrajena iz kovalentnih vezi, ki so mnogokrat močnejše od vodikovih vezi in ultrazvočna obdelava lahko zagotovi energijo, potrebno za prekinitev teh vezi.
Ali ultrazvok razbije jedrsko membrano?
A kratka ultrazvočna obdelava z nizko energijo lahko moti plazemsko membrano, ne da bi zlomilo preveč mitohondrijskih ali jedrskih membran, ki se sprostijo v taktnih mitohondrijih.
Ali je za ekstrakcijo beljakovin potrebna ultrazvočna obdelava?
Solubilizacija detergenta (npr. SDS), ki je potrebna za izolacijo membranskih proteinov, povzroči lepilni lizat predvsem zaradi nukleinskih kislin. Zato je v takih primerih potrebna ultrazvočna obdelava, da se te nukleinske kisline motijo. Sonikacija proizvaja veliko toplote in ni dobra zaveliko beljakovin.
